The words you are searching are inside this book. To get more targeted content, please make full-text search by clicking here.

Hand out Biokimia_Diploma_pak Wahyudi_2014

Discover the best professional documents and content resources in AnyFlip Document Base.
Search
Published by w.sayutipono, 2021-09-10 07:48:15

Hand out Biokimia_Diploma_pak Wahyudi_2014

Hand out Biokimia_Diploma_pak Wahyudi_2014

2

I. PENDAHULUAN 2

1.1. MAKSUD DAN TUJUAN ..............................................................................................................................................2
1.2. PENGERTIAN DAN BATASAN BIOKIMIA ................................................................................................................3
1.3. SUSUNAN LOGIS DARI BENDA MATI (NON-LIVING MATTER) DAN MAKHLUK HIDUP (LIVING MATTER) ..... 4
1.4. KETERKAITAN ILMU BIOKIMIA DENGAN ILMU LAINNYA ................................................................................... 7
1.5. IKATAN MOLEKUL DAN GUGUS FUNGSIONAL........................................................................................................8
1.6. SEL DAN STRUKTURNYA ....................................................................................................................................... 10
1.7. SEL TUMBUHAN DAN SEL HEWAN ..................................................................................................................... 14

1.7.1. Sel tumbuhan..............................................................................................................................................14
1.7.2. Sel Hewan.....................................................................................................................................................15
1.8. REAKSI BIOKIMIA DAN KEBUTUHAN ENERGI SEL............................................................................................. 16
1.8.1. Sumber energi reaksi biokimia...........................................................................................................16

II. AIR .............................................................................................................................................................. 18

2.1. PENDAHULUAN....................................................................................................................................................... 18
TUJUAN INSTRUKTIONAL UMUM (TIU) .................................................................................................................... 18
2.2. FUNGSI AIR .............................................................................................................................................................. 19
2.3. STRUKTUR DAN SIFAT AIR ................................................................................................................................... 20
2.4. IKATAN HIDROGEN PADA MOLEKUL AIR............................................................................................................ 22
2.5. AIR SEBAGAI PELARUT .......................................................................................................................................... 23

2.5.1. Air dapat melarutkan kristal garam................................................................................................23
2.5.2. Air melarutkan senyawa netral yang mempunyai gugus fungsional polar seperti
gula (ikatan ganda, hidroksil, alkohol, alhehid dan keton .................................................................24
2.6. IONISASI AIR DAN KONSTANTA KESETIMBANGAN.......................................................................................... 25
2.7. PH MENUNJUKKAN KONSENTRASI ION [H+] DAN [OH-] ................................................................................ 26
2.8. AIR SEBAGAI LARUTAN BUFFER ......................................................................................................................... 28
2.10. KUALITAS AIR MINUM ........................................................................................................................................ 29
2.10.1. AIR MINERAL .................................................................................................................................................... 29
2.10.2. VARIABEL KUALITAS AIR ............................................................................................................................... 29
3.1. BIO–MOLEKUL/MAKROMOLEKUL DALAM TUBUH MAKHLUK HIDUP........................................................... 32
LIPID ............................................................................................................................................................................... 32
PROTEIN ....................................................................................................................................................................... 32
ASAM NUKLEAT ........................................................................................................................................................ 32
3.2. KARBOHIDRAT........................................................................................................................................................ 33
3.1.1. Monosakarida.............................................................................................................................................34
3.1.2. Struktur dasar dari aldose sederhana .............................................................................................36

Buku Ajar Biokimia Diploma 3 Fakultas Kehutanan UNIPA 2

3

3.1.3. Struktur Alpha () dan Betha () dan Struktur Cincin............................................................39
3.1.3.1. Proyeksi Fisher dan Harword ..........................................................................................................39
3.1.4. REAKSI KIMIA PADA KARBOHIDRAT................................................................................................................ 40
3.1.5. IKATAN-IKATAN GLIKOSIDA ANTAR MOLEKUL-MOLEKUL MONOSAKARIDA............................................ 41
3.1.6. DISAKARIDA ........................................................................................................................................................ 41
3.1.7. POLISAKARIDA.................................................................................................................................................... 44
3.2. PROTEIN .................................................................................................................................................................. 47
3.2.1. Fungsi Protein ............................................................................................................................................47
3.2.2. Asam amino.................................................................................................................................................48
3.2.3. Sifat Keasaman dan Kebasaan Asam Amino ................................................................................48
3.2.4. Reaksi-reaksi asam amino ....................................................................................................................50
3.2.5. PEPTIDA........................................................................................................................................................50
3.2.6. Protein ...........................................................................................................................................................52
3. 3. ASAM NUKLEAT..................................................................................................................................................... 57
3.3.1. Struktur Asam Nukleat...........................................................................................................................57
3.3.2. Nukleosida ...................................................................................................................................................58
3.3.3. Struktur sekunder DNA, heliks ganda..............................................................................................61
3.3.4. Replikasi DNA.............................................................................................................................................62
3.3.5. RNA (Ribo Nucleic Acid). .......................................................................................................................62
3.3.6.Kode genetik dan sintesa protein........................................................................................................63
3.4. LIPIDA ...................................................................................................................................................................... 65
3.4.1. Penggolongan Lipid.................................................................................................................................66
3.4.2. Asam Lemak................................................................................................................................................67

Buku Ajar Biokimia Diploma 3 Fakultas Kehutanan UNIPA 3

2

Pendahuluan

I. PENDAHULUAN

1.1. Maksud dan tujuan

Bab yang pertama ini membahas tentang maksud dan tujuan pelajaran ilmu
biokimia bagi mahasiswa diploma tiga (D3) dilingkup fakultas kehutanan, yaitu D3
Management Hutan Alam Produksi (MHAP), dan Budidaya Hutan (BDH). Topik yang
lebih spesifik mendiskusikan tentang pengertian biokimia, peran biokimia dalam bidang
kehutanan dan beberapa mata kuliah atau pelajaran yang berhubungan erat dengan
biokimia. Pada akhir bab ini juga disajikan beberapa manfaat dan applikasi biokimi
dalam bidang kesehatan, lingkungan, dan kehutanan.

Tujuan Instruktional Umum (TIU)

Setelah mempelajari bab ini mahasiswa diharapkan dapat:
1. Mendefinisikan ilmu biokimia secara luas dalam bidang ilmu kehutanan
2. Mengambarkan beberapa keterkaitan ilmu biokimia dengan beberapa pelajaran

ilmu kehutanan.

Tujuan Instruktional Khusus (TUK)

Setelah menyelsaikan bab ini diharapkan:
1. Mahasiswa mampu mengidentifikasi beberapa permasalahan dalam bidang ilmu

kehutanan yang berkaitan erat dengan pemahaman pelajaran biokimia.
2. Mahasiswa dapat menjelaskan beberapa aplikasi pelajaran bikimia dalam kehidupan

sehari dan dalam bidang kehutanan

Metoda Perkuliahan

Perkuliahan dilaksanakan dengan tatap muka didepan kelas, dengan
menggunakan alat bantu in Focus dan bahan bantu lainnya. Diskusi dua arah atau
umpan balik dilaksanakan untuk lebih meingkatkan pemahaman applikasi dan beberapa
reaksi biokimi yang terjadi dan dialami oleh tubuh kita, dalam kehidupan sehari-hari.

Buku Ajar Biokimia Diploma 3 Fakultas Kehutanan UNIPA 2

3

Pendahuluan

1.2. Pengertian dan Batasan Biokimia

Istilah biokimia dapat diuraikan menjadi dua suku kata yaitu Bio dan Kimia. Bio
dapat diartikan sebagai hidup atau lebih fokusnya adalah makhluk hidup, atau
organisme yang mana dipelajari dalam ilmu biologi. Sedangkan kimia adalah kumpulan
dari atom-atom yang membentuk senyawa dengan cara saling bereaksi antara atom yang
satu dengan yang lainnya, yang secara jelas menjadi kajian dari ilmu kimia.

Kalau kita berbicara tentang kimia, sudah dapat dibayangkan tentang reaksi-
reaksi kimia yang terjadi pada tabung-tabung reaksi yang terdapat pada laboratorium.
Contoh-contoh tersebut adalah kimia konvensional atau kimia analitik misalnya.
Sedangkan kimia yang dimaksudkan pada ilmu biokimia adalah reaksi-reaksi yang terjadi
pada makhluk hidup. Sehingga biokimia dapat diterjemahkan sebagai, ilmu yang
mempelajari reaksi-reaksi kimia yang terjadi dalam tubuh makhluk hidup atau organisme
hidup terutama sel. Karena reaksi-reaski tersebut terjadi dalam tubuh makhluk hidup
(sel), maka dinamakan dengan reaksi biokimia. Jadi fokus kajian utama dari biokimia
adalah mempelajari reaksi-reaksi senyawa kimia yang terjadi dalam sel-sel makhluk
hidup, dimana dalam reaksi-reaksi tersebut memerlukan dan melepaskan energi, dan
menghasilkan beberapa proses lainnya.

Pertanyaan berikutnya adalah senyawa-senyawa kimia yang dimaksud apakah
seperti yang terdapat pada laboratorium konvensional?. Tentu saja, berbeda. senyawa-
senyawa yang terlibat dalam reaksi-reaski biokimia tersebut misalnya beberapa
makromolekul utama, seperti karbohidrat, protein, lipids, asam nukleas, dan beberapa
enzim. Reaksi-reaksi biokimia tersebut terjadi dalam sel-sel organisme.

Sehigga, apabila kita membayangkan bahwa sel-sel makhluk hidup tersebut
adalah sebuah pabrik, maka dalam tubuh kita itu terdapat berjuta-juta atau mungkin
bahkan bermilyar-milyar pabrik. Hal yang sama juga terdapat pada semua organisme
hidup seperti tumbuh-tumbuhan/pohon hutan, ternak dan satwa.

Karena objek bahasan dari biokimia itu adalah mikro reaksi (biomolecul reactions)
yang terjadi dalam sel makluk hidup, maka biokimia dapat juga didefinisikan sebagai
ilmu yang mempelajari berbagai aspek molekuler (reaksi, transportasi, metabolisme) dalam
makhluk hidup, dari makhluk yang paling sederhana (unisel) sampai pada makhluk yang
multiseluler yang sangat komplek.

Buku Ajar Biokimia Diploma 3 Fakultas Kehutanan UNIPA 3

4

Pendahuluan
Pada awalnya, tujuan pokok dari ilmu biokimia adalah menentukan bagaimana
koleksi dari molekul-molekul benda mati (senyawa-senyawa kimia) dalam benda hidup
berinteraksi satu dengan yang lainnya untuk menjaga kelangsungan proses hidup dan
kehidupan. Termasuk didalamnya adalah bagaimana reaksi-reaksi senyawa kimia
tersebut menghasilkan berbagai produk, yang mana produk-produk tersebut selanjutnya
akan dimanfaatkan oleh sel-sel tersebut untuk berbagai keperluan.
Ilmu biokimia berperan penting dalam menunjang pemahaman ilmu-ilmu hayati
dasar maupun ilmu terapan, dan menjelaskan beberapa peristiwa dan proses alam yang
menjadi kajian dari ilmu-ilmu tersebut. Beberapa argumen yang mendasari peran
penting ilmu biokimia tersebut, dikarenakan beberapa alasan ilmiah diantaranya:

• Kenyataan atau fakta menunjukkan bahwa system multienzim sangat berperan
sebagai katalis utama dalam semua aktivitas dan reaksi metabolisme, dan
transportasi energi dalam sel;

• Faktor keturunan (hereditas) adalah materi sel yang mempunyai struktur dasar yang
hampir sama pada semua organisme, dan materi genetik tersebut tersusun dari
bahan dasar yang sama pada semua organisme;

• Biokimia memberikan kontribusi yang sangat besar kepada ilmu-ilmu yang lainnya,
seperti biologi, differensiasi sel dan organisme, evolusi, dunia kedokteran, pertanian,
lingkungan dan biomolekuler modern, dan sebagainya;

• Keberhasilan ilmu biokimia dalam menerangkan beberapa penyimpangan
biomolekuler penyakit tertentu, seperti diabetes tipe , cancer, dan lainnya.

1.3. Susunan logis dari benda mati (non-living matter) dan makhluk
hidup (living matter)

Perbedaan yang sangat prinsip atau mendasar antara makhluk hidup (living
matter) dan benda mati (non-living matter) adalah bahwa benda-benda hidup mempunyai
struktur sangat komplek (Complicated structure) tetapi memiliki organisasi yang sangat rapi
(highly well-organised). Sedangkan benda mati seperti tanah, air, dan batu mempunyai
struktur yang acak, dan terdiri dari bahan kimia, atau senyawa yang sangat simple dengan
organisasi yang juga simple atau sederhana.

Sehingga, berdasarkan perpektif ilmu biokimia, benda atau makhluk hidup
hidup mempunyai ciri-ciri khusus diantaranya :

Buku Ajar Biokimia Diploma 3 Fakultas Kehutanan UNIPA 4

5

Pendahuluan

• Struktur yang sangat komplek, dan tersusun sangat-sangat rapi dalam susunan yang

sudah pasti, yaitu dari sel membentuk jaringan, dan kumpulan dari jaringan
membentuk organ serta kumpulan beberapa organ akan merupakan suatu
organisme;

• Setiap bagian dari makhluk hidup mempunyai fungsi dan sifat yang khusus, tidak

dapat digantikan oleh yang lainnya, seperti makromolekul lipid dengan protein
ataupun karbohidrat, dan bagian nukleus dengan nukleous;

• Makhluk hidup memiliki kemampuan untuk menstransfer energi dari lingkungan

sekitarnya melalui suatu membran (karbohidrat, lipida dan gula) dengan suatu
mekanisme yang sudah baku;

• Kemampuan makhluk hidup yang tidak dimiliki oleh makhluk yang lainnya adalah

kemampuan berkembang biak dan menggandakan diri (self replication) melalui
transkripsi, replikasi dan translasi;

• Makhluk hidup melakukan proses reproduksi secara akurat yang berarti selalu

menghasilkan keturunan yang selalu sama atau menggandakan diri yang hampir
selalu sama dengan induknya dan berlangsung sampai beribu-ribu generasi atau
tahun;

Selain ciri-ciri khusus tersebut, organisme juga memiliki beberapa fenomena-
fenomena dasar, yang sangat speficik. Berikut ini adalah tiga fenomena dasar dan sangat
fundamental dalam makhluk hidup yaitu:
1) Organisme hidup memiliki susunan dan komposisi yang sangat komplek, sedangkan

fungsinya hanya dikode oleh satu set molekul yang terdapat dalam inti sel yaitu
DNA (deoxyribo nucleid acid).
2) Sifat genetik tersebut sangat stabil tersimpan dalam DNA. Contohnya adalah DNA
baketri E. colli pada seratus tahun yang lalu sama dengan DNA yang hidup sekarang.
3) Transfer informasi genetik pada semua makhluk hidup terjadi melalui protein yang
berbentuk linear dan doube helik.

Dalam benda hidup terdapat prinsip-prinsip atau aturan-aturan maupun kaidah-
kaidah tertentu. Kaidah-kaidah tersebut dinamakan dengan Logika molekul. Prinsip-
prinsip dari logika molekul adalah bahwa: a) terdapat suatu keserdahanaan yang sangat
mendasar dalam struktur makromolekul biologi; b) semua organisme hidup

Buku Ajar Biokimia Diploma 3 Fakultas Kehutanan UNIPA 5

6

Pendahuluan
menggunakan molekul unit penyusun yang sama dan sepertinya diturunkan dari asal
yang sama; c) identitas setiap organisme atau species dipertahankan oleh
sekelompok/kumpulan asam nukleat dan protein yang khas bagi species yang
bersangkutan ; dan d) dan semua biomolekul mempunyai fungsi yang specifik dalam
sel.

Logika molekul sel adalah kaidah-kaidah umum yang tersusun dan terarah
menurut ilmu pengetahuan. Kaidah-kidah sel tersebut diantaranya adalah: a) sel hidup
adalah sistem isothermal organik molekul yang bersifat menyusun, menyesuaikan dan
melestarikan diri, serta memperoleh energi bebas dari lingkungan sekitarnya, b) sel
melangsungkan bebagai reaksi organik berurutan yang dikatalis oleh katalisator yang
dibuatnya sendiri, c) sel mempertahankan diri dalam keadaan mantap, d) proses
penggandaan diri yang hampir identik dari generasi ke generasi dan dilestarikannya
sistem tersebut melalui penyandian linier yang bersifat dapat memperbaiki dirinya
sendiri (self reparation).

Secara biologi molekuler, perbedaan antara benda hidup dan benda mati secara
selullar disajikan pada Tabel 1.1 berikut ini:

Tabel. 1.1. Perbedaan mendasar antara benda hidup dan benda mati.

Benda Hidup Benda mati
(living matter) (non-living matter)
Organik (protein, lipid,
karbohidrat, as. Nukleat) An organik
An organik
Dipertahankan oleh Mesin perangkat Dipertahankan oleh
transpformasi energi biokimiawi keseimbangan
berdasarkan input atau termodinamik
output materi atau energi Struktur dan fungsi kode
genetik berdasarkan distribusi
(+) random energi dan materi

Sama bagi semua makhluk (-)
hidup
(-)

Tabel 1.1 memperlihatkan bahwa perbedaan yang mendasar antara benda hidup
dan mati adalah bahwa semua maklhuk hidup memiliki komponen biokimia yang sama,
hanya berbeda dalam susunan dan komposisi. Sedangkan pada benda mati komponen
kimia penyusunnya adalah sangat berbeda satu dengan yang lain dan bukan merupakan
bio-molekul.

Buku Ajar Biokimia Diploma 3 Fakultas Kehutanan UNIPA 6

7

Pendahuluan

1.4. Keterkaitan Ilmu Biokimia dengan ilmu lainnya

Ilmu biokimia secara garis besarnya adalah landasan dasar dari semua ilmu alam
hayati (biologi). Beberapa ahli menyimpulkan bahwa dalam beberapa abad kedepan segala
gejala dalam ilmu hayati dapat diterangkan dengan ilmu bikomia, dari masalah
kesehatan/penyakit, lingkungan, obat obatan, tanaman transgenetik, pola tingkah laku,
immunitas, energy terbaharakuan, pangan dan gizi, dan sebagainya.

Keterkaitan dan hubungan ilmu biokimia dengan beberapa bidang ilmu yang
lainnya dapat digambarkan dalam bagan pada Gambar 1.1 dibawah ini.

Ilmu yang mempelajari susunan dan ILMU YANG MEMPELAJARI Ilmu yang mempelajari
sifat kimia Fungsi:
STRUKTUR: • Fisiologi,
• Kimia organik • Genetika,
• Kimia an organik • Anatomi; • Immunologi
• Kimia fisika • Sitologi;
• Histologi,
• Pathology, Zoologi,

Botani dll

Biologi molekuler Biokimia Biologi sel

Immunology Kedokteran Industri dan
Teknologi pangan
Pertanian, kehutanan, perikanan,
ilmu lingkungan, energi Ilmu makanan dan gizi
terbaharukan dan ilmu lainnya

Gambar 1.1. Keterkaitan dan hubungan ilmu biokimi dengan beberapa ilmu lainnya

Khusus di bidang kehutanan, biokimia diharapkan dapat berperan dalam
menunjang beberapa disiplin ilmu terapan seperti: Silvikultur (penggunaan zat
pengatur tumbuh (Hormon), Teknologi mikoriza, pembiakan vegetatif, kultur
jaringan/tissue culture), Pemuliaan pohon (tree improvement and plant breeding) dan
pertumbuhan pohon dan kualitas kayu (wood quality), teknologi pembenihan (seed
breeding), dan Bioteknologi kehutanan.

Buku Ajar Biokimia Diploma 3 Fakultas Kehutanan UNIPA 7

8

Pendahuluan
Dalam bidang industri kehutanan (Forest industries) beberapa applikasi ilmu
biokimia diantaranya adalah pemanfaatan beberapa enzim yang dapat mempercepat
pengkonversian kayu (sellulosa) menjadi alkoho untuk bahan bakar nabati, pemanfaatan
enzim untuk bioremidiation untuk senyawa-senyawa logam berat, dan limpahan
minyak bumi. Untuk teknologi hasil hutan seperti bidang perekatan, minyak atsiri,
fermentasi, pengembangan bahan bakar biodiesel, pengembangan potensi mibrobakteri
seperti endofit untuk obat-oabatan, jamur dan kimia bahan alam untuk tujuan medis,
dan lain sebagainya.
Setelah mempelajari ilmu biokimia kita dapat memahami berbagai fenomena
dasar kehidupan dan pertumbuhan organisme hidup itu sendiri. Disamping itu juga
mengerti berbagai konsep dan teori yang mendasari fenomena kehidupan baik yang
dalam keadaan normal maupun abnormal. Pemahaman terntang konsep dan teori yang
dipelajari dalam biokimia akan memberi kemudahan dalam menerangkan beberapa
fenomena dasar dari hudup dan kehidupan.

1.5. Ikatan molekul dan gugus fungsional

Semua makromolekul dalam benda hidup terapat dalam sel seperti karbohidrat,
lipid, protein dan asam nukleat, bersama sama dengan air. Molekul-molekul tersebut
saling berinteraksi, bereaksi dan berikatan satu dengan yang lainnya dengan ikatan kimia,
seperti ikatan ionik (ionic bond), ikatan kovalen (covalent bond), ikatan hidrogen (hydrogn
bond) dan ikatan atau gaya van der walls (van der wall forces).

Penjelasan dari masing-masing ikatan tersebut dapat diringkas sebagai berikut:

• Ikatan ionik atau sering dinamakan juga sebagai ikatan elektrostatik yaitu ikatan yang

terbentuk oleh atom-atom yang cenderung mendapat atau kehilangan elektron
secara penuh. Misalnya ikatan yang terjadi antara atom Na+ + Cl- NaCl.

• Ikatan kovalen adalah ikatan yang terjadi karena pemakaian bersama sepasang

elektron oleh dua atom. Contohnya adalah ikatan antara dua atom hidrogen,
H + H H2.

• Ikatan hidrogen adalah ikatan yang terbentuk karena atom H yang relatif bermuatan

positif oleh karena muatan elektron yang tidak setara dengan O, S , N maupun
sesama H.

Buku Ajar Biokimia Diploma 3 Fakultas Kehutanan UNIPA 8

9

Pendahuluan

• Ikatan Van der Walls terjadi karena adanya awan elektron yang terdapat disekitar

atom yang diikatkan satu sama lain oleh ikatan kovalen.

Disamping ikatan-ikatan kimi tersebut, ke-empat makromolekul dalam sel
makhluk hidup tersebut (karbohidrat, protein, lipid dan asam nukleat) berfungsi dan
berinteraksi satu dengan yang lain karena memiliki gugus fungsional. Ke-empat makro
molekul (molekul biologis) tersebut dalam tubuh makhluk hidup dapat dikenali karena
gugus fungsionalnya. Gugus fungsional dari molekul-molekul biologis dapat diringkas
sebagai berikut yaitu:

• Gugus Hidroksil (OH) dan Alkohol. Gugus fungional ini memiliki sifat yang

mudah terlepas dari molekulnya atau mudah berinteraksi membentuk molekul yang
lebih besar, menyumbang polaritas molekul karena berbagai elektron yang yang
tidak setara dengan O dan H, membentuk bagian reaktif gugus alkohol, gugus
alkohol mudah dioksidasi membentuk aldehid dan keton.

• Gugus Karbonil (C=O). Senyawa dari golongan Aldehid dan Keton dicirikan oleh

adanya ikatan rangkap antara ataom oksigen dengan karbon. Gugus karbonil banyak
ditemukan pada karbohidrat, lemak dan protein. Ikatan rangkap dua atom karbon
dengan atom O dalam karbonil (double bond/ikatan rangkap) sangat rentan terhadap
serangan kimia terutama golongan basa, dapat dioksidasi atau direduksi, merupakan
bagian aldehid dan keton yang sangat penting sebagai penyusun karbohidrat dan
lemak.

• Gugus Karboksil (COOH). Gugus funsional karboksil banyak ditemukan pada

Asam-asam organik, dan terbentuk sebagai hasil kombinasi antara gugus karbonil
dan hidroksil serta merupakan gugus fungsional khas asam-asam organik.
Reaktivitasnya terutama ditentukan oleh segment hidroksilnya, gugus hidroksil
sehingga memiliki derajat atau tingkat kepolaran sangat kuat. Gugus ini merupakan
ciri khas dari asam amino, asam lemak dan berbagai macam asam organik yang lain.

• Amina (NH2). Gugus amina adalah merupakan gugus penciri pada asam amino

atau protein dan memiliki reaktivitas kimia dan kemapuan bertindak sebagai basa
molekul organik, kondensasinya dengan gugus karboksil asam amino berikutnya

Buku Ajar Biokimia Diploma 3 Fakultas Kehutanan UNIPA 9

10

Pendahuluan
menghasilkan ikatan peptida yang merupakan rantai penyusun protein, dan gugus
amino bereaksi sebagai basa karena kemapuannya mengambil ion hidrogen

• Phosphat (PO4). Gugus fosfat berperan dalam berbagai molekul biologis, mampu

membentuk jembatan kimia yang menghubungkan bahan penyusun organik
menjadi molekul yang lebih besar seperti asam nukleat dan DNA, penting dalam
molekul yang menyimpan dan melepaskan energy dan bertindak sebagai asam
karena dapat terurai dan melepaskan ion hidrogen.

• Gugus Sulfidril (SH). Gugus fungsional ini secara biologis bertindak sebgai

tapak/tempat reaktif yaang mudah dioksidasi atau dikonversi menjadi ikatan
kovalen.

• Gugus Hidroksil (OH). Gugus hidroksil adalah gugus penciri dari alkohol dan

merupakan gugus fungsional yang dominan dalam senyarwa karbohidrat. Gugus
hidroksil melambangkan derajat kepolaran suatu senyawa kimia.

1.6. Sel dan Strukturnya

Sel merupakan pusat proses biosintesis atau biokimia dimana segala reaksi
molekuler biologis berlangsung. Mengacu kepada ilmu fisiology, sel dapat didefinisikan
sebagai unit terkecil atau fundamental, struktural dan fungsional dari semua organisme.
Unit struktural berarti bahwa organisme tersusun dari unit-unit terkecil, yaitu sel.
Sehingga kumpulan dari berjuta-juta sel menyusun organisme. Unit fungsional berarti
bahwa sel sebagai pusat segala aktivitas biologi untuk menghasilkan, mengkonversi, dan
mendistribusikan energi untuk berbagai keperluan.

Dalam teori biologi sel terdapat prinsip-prinsip dasar tentang sel secara umum.
Prinsip-prinsip tersebut, sebagian besar dapat diuraian sebagai berikut:

1. Sel adalah unit morfologis dan fisiologis terkecil semua makhluk hidup;
2. Sifat-sifat organisme tertentu tergantung pada sifat-sifat sel-sel individual;
3. Sel berasal hanya dari sel lain, dan kelangsungannya dipelihara oleh materi

genetik;
4. Sel merupakan unit terkecil kehidupan.

Buku Ajar Biokimia Diploma 3 Fakultas Kehutanan UNIPA 10

11

Pendahuluan
Secara umum, sel disusun oleh molekul, makromolekul, dan organela. Akan
tetapi, komponen yang dominan dari penyusun sel adalah air, bahan cair lainnya (aqueous
organic compounds), molekul dan makromolekul. Akan tetapi, lebih dari 70% dari massa
sel adalah dalam bentuk air, dan bahan penyusun lainnya dalam bentuk cairan kental,
menyerupai koloid. Kondisi ini yang memungkinkan bentuk fisik dari sebagian besar sel
organisme sangat elastis, artinya tidak kaku (getas), seperti benda mati lainya. Hal ini
yang menyebabkan rasa tidak sakit atau lebam tidak berlebihan, apabila tubuh kita
berbenturan dengan benda keras atau bersenggolan dengan benda asing lainnya.
Sel juga tersusun oleh berbagai macam membran dan organella. Beberapa dari
organela sel diantaranya adalah nukleus, mitokondria, reticulum endoplasma, aparatus
golgi, chlroplast, dan sebagainya. Setiap organella dalam sel memiliki fungsi sendiri-
sendiri, dan saling menunjang antara satu dengan lainnya. Setiap sel dilapisi oleh
membran yang sangat tipis, halus dan lembut, dan bersifat semipermiable. Membran
tersebut dinamakan sebagai Plasma membran (cell membrane). Semi permiable berarti
lapisan membran tersebut hanya dapat dilewati (absortion/masuk) oleh senyawa-
senyawa tertentu, dan dilalui oleh hasil atau sisa-sisa metabolisme sel. Hal ini dapat kita
rasakan pada saat tubuh kita menghasilkan keringat, yang terasa asin, serta kulit tubuh
yang dapat menahan masuknya air, sabun mandi, shampo pada saat kita mandi.
Berdasarkan susunan dan organisasi kelengkapan perangkatnya, secara umum
sel dikelompokkan menjadi dua kelompok besar yaitu: a) Prokariota atau organisme
tingkat rendah (seperti bakteri); dan b) Eukariota atau organisme tingkat tinggi (seperti
tumbuhan, hewan dan jamur). Pengklasifikasian sel dalam kelompok eukariota dan
prokariota tersebut dikarenakan adanya perbedaan yang sangat mendasar pada sel-sel
penyusunnya. Misalnya, sel eukariota mengandung nukleus sedangkan pada prokariota
tidak memiliki nukelus. Uraian perbedaan mendasar antara sel prokariota dan eukariota
disajikan pada Tabel 1.2.

Tabel 1.2. Beberapa perbedaan mesin perangkat biokimiawi antara sel prokariota dan
Eukariota.

• Organisme contoh PROKARIOTA EUKARIOTA
Bakteri, algae hijau-biru, Protozoa, algae lain, metafia dan
• Selubung nukleus
• DNA mikroplasma metazoa
(-) (+)

Telanjang Kombinasi dengan protein

Buku Ajar Biokimia Diploma 3 Fakultas Kehutanan UNIPA 11

12

• Kromoson Tunggal Pendahuluan
• Nukleolus (-)
• Pembelahan Ganda (multipel)
• Ribosom Amitosis (+)
• Endomembran 70S (50S+30S)
• Mitokondria Mitosis/meiosis
(-) 80S (60S+40S)
• Kloropast -
• Dinding sel (+)
• Ekositosis dan (-) Enzim respirasi dan fotosintetik
Nonselulose
endositosis pada membran plasma
• Lokomosi (-) (+) pada sel tumbuhan
Selulose ( hanya pada tumbuhan
Fabril tunggal, flagela
(+)

Silia dan flagela

Tabel 1.2 memberikan gambaran bahwa tumbuhan tingkat tinggi memiliki sel
dari golongan atau jenis eukariota dengan perangkat biokimiawi yang sangat lengkap.
Sehingga, organisme yang tersusun dari sel-sel eukariota adalah organisme tingkat tinggi,
atau sempurna secar sistim biokimi selnya. Untuk mengetahui lebih rinci mengenai
perbedaan dua golongan sel pada makhluk hidup ini dapat dipelajari pada pelajaran
biologi sel.

Disamping itu, sel-el eukariota juga memiliki organisasi struktural dan
fungsional yang lebih lengkap dan komplek dibandingkan dengan sel Prokariota.
Organisasi struktural dan fungsional tersebut dapat dinamakan juga sebagai orangela
penyusun sel. Orgnela-organela tersebut tersusun secara rapi, kompak dan konsisten.
Penyimpangan terhadapnya, berari penyimpangan terhadap fungsi dan struktur dari sel
terseubt. Kesempurnaan organisasi (perangkat biokimiawi) dari sel eukariota tersebut
dapat diuraikan pada Tabel 1.3 dibawah ini.

Buku Ajar Biokimia Diploma 3 Fakultas Kehutanan UNIPA 12

13

Pendahuluan

Tabel 1.3. Rincian kesempurnaan organisasi sel eukariota

Komponen utama Sub komponen Fungsi utama
(kompartemen) (sub kompartemen)
Dinding sel Proteksi
Membran sel Selubung sel Interaksi sel-sel
Membran plasma Permeabilitas, endositosis dan
Nukleus eksositosis
Sitoplasma Kromatin dan kromosom Informasi genetik
Matrik, sitosol Nukleolus
Sistem endomembran Nukleoplasma Sistesis ribosom
Enzim dapat larut Glikolisis
Organella bermembran Mikrofilamen Motilitas sel
Mikrotobulus Bentuk dan mobilitas sel
Organella mikrotubuler Ribosom Sistesis protein
Selubung nukleus Permeabilitas nukleus
Retikulum endoplasma (rough) kasar dan Sintesis dan transportmaterial
halus (smooth)
Komplek golgi Sekresi
Mitokondria Respirasi sel
Kloroplast Fotosintesis
Lisosom Digesti/pencernaan
Peroksisom Peroksidasi
Sentriol dan kumparan/spindle Pembelasahan sel
Basal bodies (benda benda basal), silia dan
flagella Mobilitas sel

Tabel 1.3 menjelaskan bahwa perangkat sel eukariota, dapat dikelompokkan
kedalam berapa kompartemen utama (fungsi utamanya). Misalnya membran sel (plasma
membrane) adalah lapisan lapisan terluar dari sel eukariota. Membran sel terdiri dari
dinding sel, selubung sel dan membran plasma. Membran sel berfungsi sebagai proteksi
(perlindungan) sel, interaksi-interaksi dengan sel-sel lainnya, dan fungsi yang
berhubungan dengan permiabilitas (arus lalu lintas pertukaran senyawa kimia antar membran).
Hal ini yang pernah disinggun pada beberapa kalimat sebelumnya tentang sifat
semipermiable dari membrane plasma.

Contoh lainnya adalah nukleous, yang menyimpan materi genetik (hereditas).
Bagian ini terdiri dari kromatin dan kromosom, nukleolus dan nukleoplasma. Nukleus
berperan aktif dalam aktivitas genetik, terutama dalam proses Replikasi, Transkripsi,
dan Translasi dalam proses sintesis DNA dan RNA.

Buku Ajar Biokimia Diploma 3 Fakultas Kehutanan UNIPA 13

14

Pendahuluan

1.7. Sel Tumbuhan dan Sel Hewan

Sel hewan dan tumbuhan termasuk kedalam kelompok sel eukariota. Kedua sel
tersebut mewakili organismeatau makhluk hidup yang sempurna, akan tetapi keduanya
memiliki persamaan dan perbedaan yang sangat menyolok. Beberapa perbedaan yang
sangat mendasar akan diuraikan dengan singkat dalam beberapa uraian dibawah ini.

1.7.1. Sel tumbuhan
Sel tumbuhan memiliki dinding sel yang sangat kuat, yang tersusun dari selulosa

(karbohidrat). Dinding cel (cell wall) ini melapisi dinding luar dari plasma membran (
plasma membrane). Dinding sel ini apabila dalam ilmu anatomi kayu, dikenal dengan
dinding sel kayu, yang terdiri dari tiga lapisan, yaitu dinding primer dan sekunder.
Dinding sekunder, terdiri dari Sekunder 1 (S1), Sekunder 2 (S2) dan Sekunder 2 (S3).
Dinding S2 yang paling tebal dibandingkan dengan S1 dan S2. Salah satu contoh dari
sel tumbuhan menurut Zubay et al. (1995) diilusterasikan pada Gambar 1.2 dibawah ini.

Gambar 1.2. Sel Tumbuhan tingkat tinggi Sumber: Zubay et al. 1995
14
Buku Ajar Biokimia Diploma 3 Fakultas Kehutanan UNIPA

15

Pendahuluan
1.7.2. Sel Hewan

Diabandingkan dengan sel tumbuhan, sel hewan lebih elastis, karena didominasi
oleh membran plasma pada seluruh strukturnya. Berbeda dengan sel tumbuhan, sel
hewan tidak memiliki dinding sel (Cell wall), sehingga lebih elastis. Sel hewan juga tidak
memiliki organela Chloroplast. Chloroplast berperan dalam proses fotosintesis
tumbuhan, terutama peran sertanya dalam mengkonversi klorofil dalam sintesis energi
melalui fotosintsis. Panampakan sel hewan menurut Zubay et al. (1995) dapat dilihat
pada Gambar 1.3.

Sumber: Zubay et al. 1995

Gambar 4. Sel Hewan tingkat tinggi

Makromolekul dalam sel, berdasarkan sifat kelarutannya dengan air, dapat
dikelompokkan kedalam tiga kelompok, yaitu Hydrophobic (tidak menyukai air), hydrophilic
(menyukai air), dan diantara keduanya (Ampiphilic).

Buku Ajar Biokimia Diploma 3 Fakultas Kehutanan UNIPA 15

16

Pendahuluan

1.8. Reaksi biokimia dan Kebutuhan energi sel

Setiap sel memerlukan energi. Energi tersebut diperoleh dari proses reaksi
biokimiawi yang berlangsung dalam sel tersebut. Setiap reaksi biokimiawi tersebut,
selalu melibatkan peran serta enzim, sebagai katalisator (pemicu reaksi). Uniknya, setiap
enzym hanya mengkatalis satu jenis reaksi. Reaksi biokimia melibatkan beberapa set
reaksi, yang mana setiap set melibatkan satu enzym.

Reaksi biokimia dilakukan untuk mengkonversi, mendistribusikan,
menggunakan, dan menyimpan energi untuk berbagai keperluan sel (organisme).
Keperluan untuk pertumbuhan, perkembangan, adaptasi, regenerasi, dan kompetisi,
seluruhnya memerlukan energi.

1.8.1. Sumber energi reaksi biokimia
Hukum kekekalan energi menyatakan bahwa energi tidak dapat diciptakan atau

dimusnakan, tetapi hanya dapat dirubah dari bentuk yang satu ke bentuk yang lain.
Darimana sumber energi reaski biokimia dalam sel atau organisme? Sumber dari segala
sumber energi dialam ini adalah Matahari. Sinar matahari dikonversi melalui proses
Fotosintesis, yang menghasilkan Oksigen (O2), Air (H2O), dan Karbohidrat. Manusia
mendapatkan energi dari mengkonsumsi makanan, dan minuman dari alam (hewan dan
Tumbuhan).

Secara sederhana, proses transfer atau perubahan energi dari sinar matahari,
melalui peristiwa fotosintesis, dan selanjutnya sampai kepada manusia, dapat
digambarkan oleh Gambar 1.4.

Sumber: Zubay et al. (1995) 16

Gambar 1.4. Bagan proses konversi energi matahari makhluk hidup

Buku Ajar Biokimia Diploma 3 Fakultas Kehutanan UNIPA

17

Pendahuluan
Berdasarkan sifat reaksinya, reaksi biokimiawi dalam sel (Metabolisme), dapat
dikelompokkan kedalam dua jenis yaitu Katabolisme dan Anabolisme. Katabolisme
adalah merubah atau mengkonversi bahan organik (makromolekul) menjadi molekl
yang sederhana. Sedangkan Anabolisme adalah penyusunan mokelul sederhana menjadi
makromolekul. Analbolisme, sering juga disebut sebagai sintesis. Sehingga anabolisme
memerlukan energi, dan katabolisme menghasilkan energi.

Pertanyaan:

1. Jelaskan dengan menggunakan kalimat saudara, tentang pengertian dari biokimia, dan
berikan contoh sederhana dari reaksi-reaksi biokimia dalam kehidupan kita sehari-
hari?

2. Carilah dua perbedaan dan persamaan yang sangat mendasar dari sel tumbuhan dan
hewan ?

3. Berikan contoh peran dari mata kuliah biokimia dalam bidang kehutanan, khususnya
bidang silvikultur dan teknologi hasil hutan ?

4. Buatlah bagan alur proses konversi energi dari energi matahari menjadi energi yang
dapat dihasilkan oleh tubuh manusia?

Rekomendasi buku bacaan :

1. Anna Poejiadi (1994). Dasar-dasar Biokimia. Penerbit Universitas Indonesia. Jakarta
2. Lehninger, A. L (1982). Dasar-dasar Biokimia. Jilid I. Alih bahasa oleh Meggy

Thenawidjaya. Penerbit Erlangga. Jakarta
3. Schumm, D. E.(1993). Intisari Biokimia. Alih bahasa oleh Moch. Sadikin. Binarupa

Aksara. Jakarta.
4. Zubay, G.L., W. W. Parson., and D.E. Vance. 1995. Principle of Biochemistry. Wm.

C. Brown Publishers. New York.
5.

Buku Ajar Biokimia Diploma 3 Fakultas Kehutanan UNIPA 17

18

Air

II. Air

2.1. Pendahuluan

Pada bab yang kedua ini membahas tentang senyawa kimia yang paling penting di alam,
dan juga bagi maklhuk hidup di alam semesta, yaitu air. Maksud dan tujuan dari bab ini
adalah agar mahasiswa diploma tiga (D3) dapat memahami dan menjelaskan tentang,
pentingnya senyawa air bagi kehidupan di alam semesta ini. Pembahasan yang lebih
spesifik, akan mendiskusikan tentang fungsi air, peran air dalam reaksi biokimia secara
keseluruhan.

Tujuan Instruktional Umum (TIU)

Setelah mempelajari bab ini mahasiswa diharapkan dapat:
• Mendefinisikan peran dan fungsi air bagi reaksi molekuler bokimiawi;
• Menjelaskan beberapa fungsi air dalam bidang ilmu kehutanan.

Tujuan Instruktional Khusus (TUK)

Setelah menyelsaikan bab ini diharapkan:
• Mahasiswa mampu menjelaskan kereaktifan dan kepolaran senyawa air pada
berbagai reaksi molekuler;
• Mahasiswa dapat menjelaskan fungsi senyawa air sebagai larutan buffer, dan
larutan fisiologis;
• Mahasiswa dapat menjelskan kenetralan senyawa air pada perhitungan nilai
kebasaan (pOH) dan keasaman (pH), dari suatu larutan.

Metoda Perkuliahan

Metoda perkuliahan dilaksanankan dengan bertatap muka didepan kelas dengan
menggunakan alat bantu in fokus, dan diskusi dua arah dari materi atau pertanyaan yang
terdapat pada bahan ajar yang telah dibagikan, kepada mahaisswa, dan bahan bantu
lainnya.

Buku Ajar Biokimia Diploma 3 Fakultas Kehutanan UNIPA 18

19

Air

2.2. Fungsi air

Air adalah merupakan molekul yang luar biasa pentingya bagi kehidupan, karena
seluruh makhluk hidup sangat tergantung kepada air. Meskipun bukan molekul organik,
tetapi air memiliki jumlah yang sangat besar dalam makhluk hidup, baik pada makhluk
yang paling sederhana (bersel tunggal), sampai kepada yang multiselullar seperti mamalia.
Secara umum, lebih dari 70 % dari bobot makluk hidup terdiri dari air atau senyawa
berair.
Bagi makhluk hidup, secara garis besarnya air memiliki beberapa fungsi antara lain
adalah: 1) media untuk memindahkan berbagai senyawa yang melintas membran; 2)
mempertahankan suhu tubuh; 3) membuat cairan pencernaan; 4) melarutkan sampah
metabolisme yang akan dibuang; 5) media reaksi biokimia dalam sel; dan 7) transfer
energy kimia. Secara khusus bagi manusia, air berperan tidak hanya mengatasi haus atau
dahaga, tetapi sangat berperan dalam memberi kelembaban pada jaringan mulut, mata,
hidung, dan melindungi organ dan jaringan vital tubuh lainnya.
Bisa dibayangkan kalau kita tidak mengkonsumsi air yang cukup, bagaimana mineral
dan zat gizi (nutrisi) yang terdapat dalam makanan yang kita konsumsi dapat
didistribusikan kedalam seluruh sel, jaringan dan organ tubuh kita. Menurut beberapa
ahli dari Indonesian Hydration Working Group (IHWG) tubuh manusia akan
mengeluarkan beberapa sinyal apabila kita kekurangan air, seperti air kencing sedikit
berwarna pekat, mulut kering, tubuh lemas, kulit kehilangan kekenyalan, jantung
berdebar-debar, tekanan darah menurun, pusing dikepala, dan mengantuk (Nova,
1311/XXVI). Dikatakan juga apabila bila kekurangan air tesebut dibiarkan, maka darah
akan mengental, dan volumenya juga akan menurun. Idealnya kita mengkonsumsi air
dalam satu hari berkisar antara 1.5 -2.5 liter per hari atau ada juga yang menyarankan
minimal 8 (delapan) gelas air minum (ukuran kurang lebih 250 ml). Anjuran ini telah
sesuai dengan yang disarankan oleh The European Food Safety Agency (EFSA).
Pendapat umum menyatakan bahwa manusia dapat bertahan hidup tanpa
mengkonsumsi makanan selama empat puluh hari, akan tetapi manusia tidak dapat
bertahan hidup lebih dari satu minggu apabila tidak mengkonsumsi air. Hal ini karena
sekitar 60 persen tubuh manusia dewasa terdiri dari air. Dalam tubuh kita, organ ginjal
berperan penting dalam memisahkan darah dan air dalam tubuh. Oleh karenanya, bila
kebutuhan air dapat tercukupi, akan sangat membantu kerja ginjal. Air minum yang kita

Buku Ajar Biokimia Diploma 3 Fakultas Kehutanan UNIPA 19

20

Air
konsumsi dapat berperan melarutkan sisa-sisa garam dalam tubuh, juga mineral dalam
tubuh.
Dalam tubuh makhluk hidup baik dalam keadaan normal ataupun sakit jumlah air yang
masuk harus dalam keadaan seimbang dalam arti bahwa jumlah air yang masuk
seimbang dengan air yang keluar. Hal tersebut diperlukan dalam rangka menjaga
kesetimbangan ketersediaan air dalam tubuh suatu organisme. Ini mengapa kalau ada
dari kita yang sakit diare harus minum air atau larutan sebanyak-banyaknya untuk
menggantikan cairan yang keluar karena diare tersebut. Bila jumlah air yang masuk lebih
besar dari air yang keluar maka tubuh kelebihan pasokan air dan keadaan ini dinamakan

dengan Odem . Kelebihan air dapat menimbulkan bengkak-bengkak, dan masalah-
masalah lain pada tubuh kita. Sedangkan keadaan kebalikannya, bilamana jumlah air
yang keluar dari tubuh lebih banyak dari pada yang masuk maka tubuh kita akan
kekurangan air, kondisi yang dinamakan dengan dehidrasi. Kondisi tersebut dapat
terjadi pada olahragawan yang menghasilkan keringat berlebihan, muntah-muntah
ataupun diare diare pada orang sakit terutama pada balita dan anak-anak.
Bagaimana tubuh kita mendapatkan air? Manusia mendapatkan air melalui melalui
makanan yang kita konsumsi, minuman yang diminum, dan air yang berasal dari proses
metabolik (hasil oksidasi dari bahan-bahan makanan dalam tubuh). Misalnya hasil
oksidasi dari setiap 100 g protein, karbohidrat dan lemak akan menghasilkan secara
berurutan 41, 55 dan 107 g air. Sedangkan proses keluarnya air dalam tubuh manusia
melaui beberapa mekanisme, mislanya air urine, tinja (faces), penguapan, dan keringat.

2.3. Struktur dan Sifat Air

Air mempunyai struktur dan sifat yang sangat berbeda dengan pelarut-pelarut organik
lainnya. Air adalah suatu hidrid oksigen yang menunjukkan beberapa perbedaan dengan
hidrid lainnya seperti dijelaskan pada Tabel 2.1.

Tabel 2.1. Perbedaan titik didih dan leleh serta panas penguapan tiga jenis hidrida

Hidrida Titik leleh (0oC) Titik didih (0oC) Panas penguapan (kal/g)

H2O 0 100 540

H2S -85 -60 132

NH3 -78 -33 327

Buku Ajar Biokimia Diploma 3 Fakultas Kehutanan UNIPA 20

21

Air
Tabel 2.1 menjelaskan bahwa titik leleh air, titik didih, dan panas penguapan yang
dimiliki oleh air sangat besar dibandingkan dua senyawa lain. Ini menunjukkan bahwa
adanya kekuatan antar molekul yang kuat dalam cairan air yang ditentukan oleh sifat
dipolarnya. Molekul air memiliki struktur yang sangat terkutub. Atom oksigen dalam
molekul air cenderung menarik elektron dari ikatan kovalen H-O, karena oksigen
memiliki elektronegatif yang sangat tinggi dibandingkan dengan hidrogen. Daerah
sekitar atom oksigen menjadi daerah negatif (-) sedangkan daerah sekitar atom
hidrogren menjadi partial positif (+), lihat Gambar 2.1. Tingginya sifat dua kutub
menyebabkan tingginya tetapan dialekrik air.
Sehingga kalau ada pertanyaan bahwa mengapa air memperlihatkan gaya tarik antar
molekul yang demikian kuat? Jawabanya adalah karena struktur moleku air dimana
setiap atom hidrogen dari air (dua) memakai bersama sepasang elektron dengan atom
oksigen. Kedua pasang elektron atom oksigen yang tidak terpakai, bersama menyebakan
atom ini bermuatan negatif sebagian pada ujungnya yang berbentuk V. Walaupun
molekul air adalah bersifat netral, muatan positif dan negatifnya terpisah, sehingga

molekul ini dinamakan dipole elektrik atau polar. Sedangkan molekul atau senyawa non-
polar adalah molekul atau senyawa yang tidak memperlihatkan kecenderungan relatif
yang sangat kecil untuk saling tarik menarik secara elektrostatik. Energi yang jauh lebih
sedikit diperlukan untuk memisahkan mol cairan ini (benzen dan heksane). Karena
itulah panas penguapan heksane dan benzena jauh lebih kecil dibandingkan dengan air.

Buku Ajar Biokimia Diploma 3 Fakultas Kehutanan UNIPA 21

22

Air

2.4. Ikatan Hidrogen pada molekul air

Ikatan hidrogen terbentuk karena terjadinya tarik menarik elektrostatik (elektronegatif
atom O dan N) antara satu kutub suatu kutub rangkap dengan suatu kutub suatu kutub
rangkap lainnya. Keadaan ini dapat terjadi bila dua kutub rangkap sangat dekat satu
dengan lainnya. Perataan atom oksigen yang dalam molekul air yang hampir tetrahedral
menyebakan air secara potensial mampu membuat ikatan hidrogen dengan dengan
empat molekul lainnya. Ikatan hidrogen yang terjadi pada molekul air, diperlihatkan
pada Gambar 2.1 dibawah ini.

Sumber: Zubay et al. (1995)

Gambar 2.1. Molekul air (a), ikatan hidrogen antar dua molekul air (b), dan cluster dari
molekul air (c).

Gambar 2.1 (a) menjelaskan sifat elektronegatif (δ-) dari atom oksigen (O2), dan

elektropositif (δ+) dari atom hidrogen (H), serta terbentuknya formasi V pada molekul
air. Ikatan hidrogen yang terjadi antara dua molekul air, diperlihatkan oleh Gambar 2.1
(b), sedangkan ikatan hidrogen pada antara lima molekul hidrogen (Cluster), dilukiskan
oleh Gambar 2.1(c). Sedangkan Gambar 1.2 yang sebelah kanan, memperlihatkan
molekul air dalam bentuk kristal es (Ice crystal).

Buku Ajar Biokimia Diploma 3 Fakultas Kehutanan UNIPA 22

23

Air
Ikatan hidrogen inilah yang menyebakan air merupakan suatu larutan dengan kohesi
internalnya sangat kuat dan merupakan suatu pelarut yang relatif terstruktur. Ikatan
hidrogen, tidak hanya terjadi antara sesama molekul air saja, tetapi juga dapat terjadi
pada beberapa biomolekul lainya. Contoh-contoh kemungkikan terjadinya ikatan
hidrogen pada biomolekul, dapat disajikan pada Tabel 2.2.

Tabel 2.2. Contoh beberapa ikatan hidrogen yang dapat terjadi pada beberapa molekul
biokimia

Donor hidrogen Aseptor hidrogen
O=H
−O−H N
O
−O−H CO
-O-H O
NH N
NH
NH

Salah satu, ciri khas atau sifat dari ikatan hidrogen adalah bahwa ikatan hidrogen
memiliki energi yang paling kuat, sehingga diperlukan energi yang cukup kuat untuk
dapat melepaskannya. Jika molekul yang berikatan hidrogen, berorientasi sedemikian
rupa maka akan terjadi interaksi elektrostatik secara maksimum.

2.5. Air sebagai pelarut

Sebagai pelarut serbaguna atau netral, air mempunyai kontribusi yang sangat besar
dalam reaksi-reaksi kimia maupun biokimia dalam sel tubuh organisme. Sebagian dari
reaksi-reaksi tersebut akan dibahas dibawah ini seperti:

2.5.1. Air dapat melarutkan kristal garam
Jika NaCl + H2O akan menghasilkan bahwa molekul air tertarik secara kuat diantara
ion-ion Na+ dan Cl- dan menarik keluar dari kristal kristal dan mebentuk ion Na+ dan
Cl- didalam larutan.

Buku Ajar Biokimia Diploma 3 Fakultas Kehutanan UNIPA 23

24
Air

Air melarutkan senyawa organik yang mempunyai karbonil atau amino yang cenderung
berionisasi oleh interaksinya dengan air.

2.5.2. Air melarutkan senyawa netral yang mempunyai gugus fungsional polar
seperti gula (ikatan ganda, hidroksil, alkohol, alhehid dan keton

Buku Ajar Biokimia Diploma 3 Fakultas Kehutanan UNIPA 24

25

Air

2.6. Ionisasi Air dan Konstanta Kesetimbangan

Ionisasi dan konstanta kesetimbangan (constanta equilibrium) dari senyawa air
dilambangkan dengan Keq. Ionisasi air membentuk ion hidrogen dan hidroksida secara
sempurna dan bersifat timbal balik (reversible) seperti yang dinyatakan oleh persmaan
berikut ini:

H2O ⇆ H+ + OH¯

Sehingga konstanta kesetimbangan dapat dinyatakan dengan:

[H+] [OH-]
Keq = --------------------

[H2O]
Pada suhu 25oC diperkirakan 1 dari 10 juta molekul air murni yang terionisasi, tetapi
biarpun molekul air yang mengionisasi sedikit, keberadaan ion [H+] dan [OH-] sangat
penting dan nyata dalam biologi kehidupan. Tingkat ionisasi air secara kuantitatif
dinyatakan dengan konstanta kesetimbangan.
Karena konsentrasi H2O reaktif tinggi (ektivalen dengan jumlah gram H2O dalam 1
liter dibagi dengan berat molekulnya yaitu 1000/18 = 55.5 M). Ion [H+] dan [OH-]
bersifat konstan pada konsentrasi yang sangat rendah. Air murni dengan suhu 25oC
dengan nilai kesetimbangan 1.0 x 10-7 M. Sehingga konsentrasi [H2O] pada
kesetimbangan dapat disubtitusikan menjadi

[H+] [OH-]
Keq = --------------------

55.5 M
sehingga diperoleh 55.5 M x Keq = [H+] [OH-]. Konstanta kesetimbangan disosiasi air
murni pada suhu 25oC adalah 1.8 x 10-16 . Sehingga substitusinya adalah

(55.5 ) x (1.8 x 10-16 ) = [H+] [OH-] 25
99.9 x 10-16 = [H+] [OH-]
1.0 x 10 –14 = [H+] [OH-]

Buku Ajar Biokimia Diploma 3 Fakultas Kehutanan UNIPA

26

Air

Kw = 1.0 x 10 –14 = [H+] [OH-]

Hasil kali 55.5 M x Keq dinamakan dengan produk ion (hasil kali ion) dari air dan
dilambangkan dengan Kw . Nilai Kw air murni pada suhu 25oC adalah 1.0 x 10 –14 , yang
berarti produk larutan [H+] [OH-] pada larutan encer pada 25oC akan selalu konstant
nilai 1.0 x 10 –14. Apabila terdapat konsentrasi yang sama antara [H+] dan [OH-] seperti
pada air murni maka larutan ini bersifat netral. Sehingga konsentrasi ion [H+] dan [OH-
] dapat dihitung dari produk ion air sebagai berikut

Kw = [H+] [OH-] = [H+]2
[H+]2 = √ Kw = √ 1.0 x 10-14
[H+]2 = [H+] [OH-] = 10-7 M.

Dari produk ion air dinyatakan bahwa jika konsentrasi ion [H+] lebih besar dari 1.0 x
10-7 M, maka konsentrasi [OH-] harus berkurang dari 1.0 x 10-7 M dan sebaliknya. Jadi
jika konsentrasi [H+] sanat tinggi (NaCl) maka konsentrasi [OH-] tentu sangat rendah
karena hasil kali keduanya harus tetap sama dengan 1.0 x 10-14 M.

2.7. pH menunjukkan konsentrasi ion [H+] dan [OH-]

Kw atau hasil kali produk air adalah dasar perhitungan bagi skala pH. Istilah pH
dinyatakan dengan persamaan

1
pH = log ----- = - log [H+]

[H+]
Hubungan antara pH dan pOH dapat digambarkan dalam Tabel 2.3 berikut.

Buku Ajar Biokimia Diploma 3 Fakultas Kehutanan UNIPA 26

27

Air

Tabel 2.3. Hubungan antara pH dan pOH

[H+] M pH [OH-] M pOH
1.0
0.1 0 10-14 14
0.01 1 10-13 13
0.001 2 10-12 12
10-4 3 10-11 11
10-5 4 10-10 10
10-6 5 10-9 9
10-7 6 10-8 8
10-8 7 10-7 7
10-9 8 10-6 6
10-10 9 10-5 5
10-11 10 10-4 4
10-12 11 0.001 3
10-13 12 0.01 2
10-14 13 0.1 1
14 1.0 0

Pada larutan yang benar-benar netral pada suhu 25oC dengan konsentrasi ion hidrogen

1.0 x 10-7 M maka pH dapat dihitung

1

PH = log ------ = log (1 x 107)

1.0 x 10-7 M

= log (1.0 + log 10 7)
= 0 +7
=7

Nilai pH 7 bagi larutan yang netral diturunkan dari harga absolut produk air pada 25oC
sehingga larutan yang memiliki pH lebih dari 7 bersifat basa karena konsentrasi OH
lebih besar dari H+ dan sebaliknya larutan dengan pH kecil dari 7 adalah asam karena
konsentrasi H+ lebih besar dari OH-.
Kadang-kadang persamaan pOHdipergunakan untuk menunjukkan tingkat kebasaan
atau konsentrasi OH- pada suatu larutan

Buku Ajar Biokimia Diploma 3 Fakultas Kehutanan UNIPA 27

28

Air

1
pOH= log ------ = -log [OH-]

[OH-]

sehingga pOH dari 0.1 M OH- adalah 1 da pOH dari 10-7 adalah 7. PH dan pOH saling
berikatan satu sama lain dalam air murni sehingga pH + pOH = 14
Karena peranan pH yang sangat penting dalam struktur dan aktivitas makromolekul
biologis seperti katalisator kinerja enzim. Pada bidang kesehatan pengukuran pH darah
dan urine (air kencing) dapat dipergunakan untuk mendiagnosa berbagai penyakit seperti
gula darah, kolesterol, asam urat dan sebagainya. pH plasma darah orang yang menderita
diabetus melitus cronis lebih rendah dari pH normal 7.4. Keadaan ini dinamakan dengan
Asidosi sedangkan bila pH darah tinggi disebut dengan Alkalosis.

2.8. Air Sebagai Larutan Buffer

Buffer adalahsistem cairan yang cenderung mempertahankan perubahan pH jika terjadi
pada penambahan sedikit asam (H+) atau basa (OH-). Suatu sistem buffer terdiri dari
asam lemak (donor proton) dan basa konjugasinya (akseptor proton). Kekuatan buffer
adalah merupakan ekspresi dari dua reaksi kesetimbangan bolak balik yang sangat
mendasar dalam larutan suatu unsur proton dan akseptor.

Gambar berikut adalah kinerja kesetimbangan asam asetat dan ion asam asetat yang
bekerja dengan sistem buffer yang menyerap H+ dan OH melalui sifat dasar balik reaksi
diasosiasi asam asetat.

2.9. Larutan Fisiologis
Cairan intraselullar dan extracellular semua organisme cenderung mempunyai pH dan
konstanta yang khas, yang diatur oleh berbagai aktivitas energy. Akan tetapi garis
pertahanan (defend system) pertama organisme makluk hidup terhadap perubahan pH
internalnya dikendalikan oleh sistem buffer. Kedua sistem buffer yang khas pada
mamalia adalah sistem posfat dan bikarbonat. Sistem buffer posfat terdiri dari pasangan
asam-basa konjugat H2PO4 sebagai donor proton dan H2PO4 2- sebagai akseptor proton.

Buku Ajar Biokimia Diploma 3 Fakultas Kehutanan UNIPA 28

29

Air
Dalam plasma darah, buffer bikarbonat yang utama adalah asam karbonat (H2CO3)
sebagai donor proton dan bikarbonat (CHCO3-) sebagai akseptor proton.
Sistem buffer karbonat adalah buffer fisiologis yang sangat effectik pada pH 7.4 karena
donor proton H2CO3 dalam plasma darah berada dalam kesetimbangan dengan
ketersediaan gas CO2 dalam ruang udara paru-paru. Pada saat darah harus menyerap
kelebihan OH-, H2CO3 dalam darah dan berubah menjadi HCO3- karena bereaksi
dengan OH- di kembalikan dari tempatnya yang berlimpah didalam fase gas CO2 pada
paru-paru. Sebaliknya apabila pH darah menurun, HCO3- bereaksi dengan H+
membentuk H2CO3. Senyawa ini terurai menjadi CO2 terlarut yang selanjutnya
dilepaskan sebagai CO2 fase gas dalam paru-paru dan dikeluarkan dari tubuh.
Ketika darah mengalir melalui sejumlah kapiler halus didalam paru-paru, sistem buffer
bikarbonat berada dalam kesetimbangan dengan CO2 didalam rongga paru-paru.
Kerjasama diantara dua sistem buffer bikarbonat dan aktivitas paru-paru menghasilkan
mekanisme yang amat responsif untuk mempertahankan pH darah supaya tetap.

2.10. Kualitas Air minum

2.10.1. Air mineral
2.10.2. Variabel kualitas Air

Pertanyaan dan Latihan Soal.

Produk ion air dapat dipergunakan untuk menghitung konsentrasi ion [H+] dan [OH-]

jika konsentrasi slah satunya diketahui. Perhatikan soal berikut

1. Berapa konsentrasi H+ dalam larutan 0.1N NaOH?

Kw = [H+] [OH-]
Kw 1.0 x 10-14
[H+]= ---------- = -------------------
[OH-] 0.1

10 -14
= -------------- = 10-13 M

10-1

Buku Ajar Biokimia Diploma 3 Fakultas Kehutanan UNIPA 29

30

Air
2. Berapakah konsentrasi OH- didalam larutan yang mengandung konsentrasi H+
sebanyak 0.00013 M ?.

Rekomendasi bahan bacaan :

1. Anna Poejiadi (1994). Dasar-dasar Biokimia. Penerbit Universitas Indonesia.
Jakarta

2. Lehninger, A. L (1982). Dasar-dasar Biokimia. Jilid I. Alih bahasa oleh Meggy
Thenawidjaya. Penerbit Erlangga. Jakarta

3. Nova 1311/XXVI. Seribu Manfaat Minum Air. 8-14 Maret 2013 Hal.39.
4. Sofro, A.S.M (1997). Biokimia. (Ruang lingkup; Ikatan molekul dan Gugus

fungsional; pH buffer dan Air; Bioenergetika dan oksidasi biologis. PAU-
Bioteknologi Universitas Gajah Mada (tidak diterbitkan
)

Buku Ajar Biokimia Diploma 3 Fakultas Kehutanan UNIPA 30

31

BIomolekul

Bab III

Bio-Molekul

Topik ini membahas tentang peran dan fungsi dari empat Bio-molekul atau
makromolekul utama dalam ilmu biokimia. Keempat biomolekul tersebut adalah
karbohidrat, protein, lipid dan asam nukleat. Maksud dan tujuan dari topik Bio-molekul
adalah agar mahasiswa diploma tiga (D3) budidaya hutan dapat menjelaskan peran dan
fungsi dari keempat Bio/makromolekul tersebut dalam bidang biokimia. Topik yang
lebih spesifik mendiskusikan tentang fungsi dan peran masing-masing molekul dalam
reaksi biokimiawi makhluk hidup, termasuk tumbuh-tumbuhan kehutanan.

Tujuan Instruktional Umum (TIU)

Setelah mempelajari bab ini mahasiswa diharapkan dapat:
3. Mendefinisikan gugus penciri (fungsional) dari keempat makromolekul biologi;
4. Mengerti peran dan konstribusi dari masing-masing biomolekul dalam reaksi

biokimiawi;
5. Mengambarkan beberapa keterkaitan empat makromolekul dengan beberapa

pelajaran ilmu kehutanan.

Tujuan Instruktional Khusus (TUK)

Setelah menyelesaikan bab ini diharapkan:
3. Mahasiswa mampu mengenali dan membedakan gugus fungsional masing-masing

bio/makromolekul biologi tersebut;
4. Mahasiswa dapat menjelaskan peran dan fungsi masing-masing biomolekul dalam

reaksi biokimawi;
5. Menjelaskan unit penyusun (monomer), ikatan antar monomer, dan polimer dari

keempat biomolekul tersebut.

Metoda Perkuliahan

Metoda perkuliahan dilaksanakan dengan tatap muka didepan kelas,
memberikan salinan bahan ajar (hand out), dan menyajikan materi kuliah dengan bantuan

Buku Ajar Biokimia Diploma 3 Fakultas Kehutanan UNIPA 31

32

BIomolekul
in Focus. Gambar-gambar tiga dimensi dari protein, asam nukleat, ditampilkan dengan
slide dan dijadikan bahan diskusi.

3.1. Bio–molekul/Makromolekul dalam tubuh makhluk hidup

Lipid adalah molekul hidrocarbon yang sedikit larut dalam air, dan digunakan sebagai
cadangan energi untuk metabolisme sel. Karbohidrat adalah rantai karbon dengan
banyak polar group (-OH) atau hidroksil sehingga sangat mudah larut/bereaksi dengan
air. Polimer dari karbohidrat adalah polysacharida/gula. Unit penyusun (sub unit) dan
fungsi dari ketiga makromolekul disajikan pada Tabel 3.1

Tabel 3.1. Unit penyusun (sub unit) dan fungsi dari karbohidrat, Lipid, Protein dan Asam
Nukleat.

Makromolekul Subunit Fungsi Contoh
POLYSAKARIDA
 Pati dan glykogen Glukosa Cadangan energy Kentang
 Selulosa Glukosa Komponen dinding sel Kertas
 Chitin Glukosa yang ter- Komponen dinding sel Kulit kepiting
modifikasi (Crab shells)
LIPID
Glycerol + 3 fatty acid Cadangan enrgy Keju
 Lemak (fats) Glyserol + 2 fatty acid + Komponen membran sel Sabun
 Phospholipids phosphate membrane, hormon
4 karbon ring pigment dan struktural Cholesterol,
 Steroids rantai karbon panjang estrogen
 Terpenes Chlorophyll
PROTEIN dan karet

 Globular Asam amino Enzym katalis Hemoglobin
 Struktural Asam amino Komponen pendukung Rambut,
(support) Sutera

ASAM NUKLEAT Nukleotida Mengkode gen Chromosom
Nukleotida Bahan cetakan dari gen Virus flu
DNA
RNA

Polysacharida disusun oleh molekul-molekul gula yang dihubungkan dengan
ikatan glikosida. Protein adalah makromolekul yang sangat komplek dalam sel, terdiri
dari rantai lurus yang disebut Polipeptida yang terdiri dari asam-asam amino yang
dihubungkan dengan ikatan peptida. Atom C pada setiap asam amino mengikat: sebuah

Buku Ajar Biokimia Diploma 3 Fakultas Kehutanan UNIPA 32

33

BIomolekul
carboksil group, satu aminop group, sebuah atom hydrogen dan sebuah R group dan
terdapat 20 asam amino.

Asam nukleat adalah makromolekul terbesar yang terdapat pada sel. Asam
nukleat adalah polymer yang linear (tidak bercabang), sangat panjang, dan dinamakan
dengan polynukleotida, disusun oleh nukelotida. Satu molekul nukleotida terdiri dari:
satu molekul gula 5 karbon, satu atau lebih molekul posphate, dan basa nitrogen (Purine,
Adenine dan Guanine), Pyrimidine (Uracil, Cytosine dan Thymine). Sequence atau
urutan dari basa nitrogen dalam asam nukleat akan menentukan jenis protein. Asam
nukleat dibedakan menjadi dua yaitu, DNA (deoxyribose nucleid acid), RNA
(ribonucleid acid).

3.2. Karbohidrat

Karbohidrat adalah produk alami dari tumbuh-tumbuhan hijau hasil proses
Fotosintesis, yaitu dengan mengubah karbondioksida dan air menjadi senyawa
karbohidrat (glukosa/selulosa/pati) dengan bantuan sinar matahari. Tiap tahun
diperkirakan kurang lebih 100 trilyun metric ton selulosa diproduksi oleh tanaman dan
algae melalui proses fotosintesis (Campbel 1980). Pada tanaman berkayu selulosa
berfungsi sebagai struktur pembangun dinding sel, pelindung dari dinding sel dan
sebagai kerangka pengabungan serta bahan perekat antar sel.

Karbohidrat adalah sumber kalori bagi manusia dan hewan. Manusia
mengkonsumsi karbohidrat setiap hari baik dalam bentuk gula ataupun bentuk lainnya.
Karbohidrat adalah polyhidroxy dari Aldehyd dan Keton. Karbohidrat mempunyai

struktur dasar Cn(H2O)n, dengan perbanding antar unsur penyusunnya adalah 1:2:1.

Karbohidrat sering disebut juga dengan polihidroksialdehid atau polihidroksiketon,
karena molekul hidroksil, aldehid dan keton adalah penyusun utamanya.

Karbohidrat dapat diklasifikasikan kedalam tiga golongan besar yaitu:

• Monosakarida (mono sacharida);

• Oligosakarida (olygo sacharida);

• Polisakarida (polysacharida)

Karbohidrat adalah golongan sakarida (berasal dari bahasa latin saccharum yang
berarti gula), dan merupakan penyusun utama (skeleton) dari gula. Monosakarida atau

Buku Ajar Biokimia Diploma 3 Fakultas Kehutanan UNIPA 33

34

BIomolekul
dinamakan juga gula sederhana yang merupakan molekul tunggal dari polihidroksi
aldehyd atau polihidroksi keton. Monosakarida yang paling melimpah dan terdapat
dialam adalah gula 6 atom karbon yaitu dari jenis D glukosa. Oligosakarida adalah
senyawa dua atau lebih dari monosakarida yang dihubungkan dengan ikatan glikosida.
Sedangkan disakarida adalah gabungan dua monosakarida dan di alam terdapat dalam
bentuk Sukrosa (gula tebu), laktosa (gula susu) dan Maltosa. Polisakarida adalah
merupakan kumpulan monomer monosakarida seperti selulosa dan pati.

Hasil hidrolisis dari ketiga kelas utama karbohidrat tersebut (monosakarida,
oligosakarida, dan polisakarida) adalah saling berkaitan erat dapat digambarkan dalam
bagan sebagai berikut:

H2O H2O
Polisakarida ──→ Oligosakarida ──→ Monosakarida
H+ H+

Contoh khasnya adalah hidrolisis pati dengan hasil akhir glukosa

nH2O nH2O

[C12H20O10]n ──→ ──→nC12H22O11 C6H12O6

Pati Maltosa Glukosa

(Polisakarida) (disakarida) (monosakarida)

3.1.1. Monosakarida
Mono sakarida adalah gula sederhana yang tidak dapat dihidrolisis (diuraikan)

lagi menjadi komponen yang lebih kecil. Jadi mono sakarida adalah unit penyususn
karbohidarat yang paling kecil. Apabila monosakarida tersusun dari kelompok aldehid
dinamakan aldosa, sedangkan kelompok monosakarida yang mengadung gugus keton
disebut ketosa. Monosakarida dari kelompok aldosa dalam penamaanya diberi akiran
Ose (hexose), dan untuk keton berakiran Ulose (ribulosa).

Buku Ajar Biokimia Diploma 3 Fakultas Kehutanan UNIPA 34

35

HO BIomolekul

\ // H

C H ⎯ C ⎯ OH
 
C===O
H ⎯C ⎯ H


H ⎯C ⎯ OH H ⎯C ⎯ OH

 
H H
Glyceraldehyda Dihidroxy aceton
(an aldose) (an ketose)

Gambar 3.1. Monosakarida dari aldehid dan keton

Monosakarida tidak berwarna, berbentuk kristal padat, dan larut dalam air,
tetapi tidak larut dalam larutan atau pelarut non-polar, serta pada umumya mempunyai
rasa manis. Rantai monosakaria tidak bercabang, dimana semua atom carbon
dihubungkan oleh ikatan tunggal, satu atom carbon berikatan rangkap dengan oksigen
serta gugus hidroksil pada atom karbon-karbon lainnya.

Bila gugus karbonil (ikatan rangkap carbon dengan oksigen) terdapat pada ujung
rantai karbon, maka dinamakan dengan monosakarida dari aldehyde dan dinamakan
sebagai aldosa (misalnya gliceraldehyde). Sedangkan bila gugus karbonil berada pada
posisi aton carbon lainnya, disebut sebagai monosakarida dari ketone dan dinamakan
dengan ketosa ( misalnya dehidroxy aceton). Monosakarida yang tersusun dari 4 atom
carbon dinamakan dengan tetrosa, lima atom carbon disebut pentosa, sedangkan
hexosa dan heptosa adalah monosakarida yang mempunyai atom karbon sebanyak
enam dan tujuh.

Dalam applikasinya, senyawa monosakarida terdapat dalam bentuk foramasi,
yaitu aldohexosa D-glukosa yang berikatan aldehyde, dan ketohexosa D- fruktosa yang
berikatan ketone, seperti digambarkan pada Gambar 3.2.

Buku Ajar Biokimia Diploma 3 Fakultas Kehutanan UNIPA 35

36
BIomolekul

H HO

H ⎯C ⎯OH \ //

C==O C

 H ⎯C⎯OH

HO⎯C ⎯ H 

 HO⎯C ⎯H
H ⎯ C ⎯ OH

 H ⎯C ⎯OH
H ⎯ C ⎯ OH

 H ⎯C⎯OH

CH2 OH 
D-fruktosa
CH2 OH

D-Glukosa

Gambar 3.2. Fomasi monosakarida D-fruktosa dan D-glukosa

3.1.2. Struktur dasar dari aldose sederhana
Dua formasi yang umum digunakan dalam mengambarkan struktur formula dari suatu
molekul monosakarida adalah formasi fisher (rantai terbuka), dan berdasarkan hasil
konvensi adalah terdiri dari dua konfigurasi terbuka, yaitu formasi D dan L. D yang
berarti Dectro mengambarkan gugus hidroksil (OH) pada sisi kanan atom Carbon,
sedangakn pada konfigurasi L, gugus hidroksilnya berada pada sisi kiri atom Carbon
(left hand).

Hal ini bisa digambarkan secara sederhana apabila kita mengamati gambar kita
pada cermin kaca hias, dimana tangan kanan (sisi tubuh sebelah kanan kita) akan tampak
berada pada sebelah kiri pada bayangan. Contoh sederhananya adalah gula sederhana
tiga carbon yaitu D Glyceraldehyde dan L Glyceraldehyde. Kedua monosakarida
tersebut apabila diproyeksikan dengan proyeksi Fisher, dapat ditampilkan seperti pada
Gambar 3.3.

Buku Ajar Biokimia Diploma 3 Fakultas Kehutanan UNIPA 36

37

BIomolekul

. CHO CHO Terbentuknya formasi dari D ke L atau sebaliknya
  terjadi pada atom C kedua, Ini terjadi karena
HO⎯C⎯H adanya sifat kiralitas pada atom Carbon yaitu
H⎯C⎯OH  keempat kaki dari atom Carbon mengikat atom
CH2 OH atau unsur yang berlainan. Sehingga bila gugus
 hidroksi (OH) berada pada sisi kiri atom Carbon
CH2 OH L Glyceraldehyde maka formasinya dinamakan dengan formasi L
sedangkan pada sebelah kanan Carbon membentuk
D Glyceraldehyde formasi D.

Gambar 3.3 Proyeksi Fisher dari senyawa tiga karbon Glyseraldehid.
Selain tersusun dari tiga atom karbon, beberapa monosakarida juga disusun oleh

empat, lima, enam, bahkan tujuh atom karbon, aldotriose, aldoteetrose, aldopentose
dan D isomer dari aldohexose. Senyawa-senyawa monosakarida tersebut dapat
ditampilkan pada Gambar 3.4 dibawah ini.

Aldotetrose

HO HO

C C
 
H⎯C⎯OH
HO⎯C⎯H

H ⎯ C ⎯OH 
H ⎯ C ⎯OH

CH2OH 
CH2OH
D Erytrose
D Threose

Aldopentose H O
C
HO HO
C C 
 
H⎯C⎯OH
HO⎯C⎯H HO⎯C⎯H

  HO⎯C⎯H
H⎯C⎯OH HO⎯C⎯H

  H ⎯ C ⎯OH
H ⎯ C ⎯OH H ⎯ C ⎯OH

  CH2OH
CH2OH CH2OH

D Cylose

Buku Ajar Biokimia Diploma 3 Fakultas Kehutanan UNIPA 37

38

Aldohexose D Arabinose HO BIomolekul

HO HO C D Xylose

C C H ⎯C⎯OH HO
 
H ⎯C⎯OH HO ⎯C⎯H  C

  HO⎯C ⎯H HO ⎯C⎯H

H ⎯C ⎯OH H ⎯C ⎯OH  HO ⎯C ⎯H
H ⎯C ⎯ OH 
  H ⎯C ⎯ OH
H ⎯C ⎯ OH H ⎯C ⎯ OH  
H ⎯C⎯OH H ⎯C⎯OH
  
H ⎯C⎯OH H ⎯C⎯OH  CH2 OH
D Mannose
  CH2 OH

CH2 OH CH2 OH D Glukose

D Allose D Altrose

H H H H
| | | |
C=== O C=== O C=== O C=== O
   
H ⎯C⎯OH HO ⎯C⎯H HO ⎯C⎯H H ⎯C⎯OH
   
H ⎯C ⎯OH H ⎯C ⎯OH HO ⎯C ⎯H HO ⎯C ⎯H
  
 HO ⎯C ⎯ H HO⎯C ⎯ H HO⎯C ⎯ H
HO⎯C ⎯H   
H ⎯C⎯OH H ⎯C⎯OH H ⎯C⎯OH
   
H ⎯C⎯OH CH2 OH CH2 OH
D Iodose D Talose CH2 OH
 D Galaktose
CH2 OH
D Glulose

Gambar 3.4 Senyawa-senyawa monosakarida

Epimer adalah monosakarida yang mempunyai jumlah atom karbon sama, akan
tetapi memiliki pebedaan susunan atom pada salah satu atom Carbonnya.

C1 HO CHO CHO
  
H ⎯ C2 ⎯OH H ⎯C⎯OH
 HO ⎯C⎯H 
HO ⎯ C3 ⎯H  HO ⎯C ⎯H
 
H⎯ C4 ⎯OH H ⎯C ⎯OH HO⎯C ⎯H
 
 H ⎯C⎯OH
H ⎯ C5 ⎯OH HO⎯C ⎯H 
 CH2 OH

H ⎯C⎯OH D Galaktose
C6 H2 OH 
D Glulose Epimer pada C4
CH2 OH

D Glulose

Epimer pada C2

Buku Ajar Biokimia Diploma 3 Fakultas Kehutanan UNIPA 38

39

BIomolekul

3.1.3. Struktur Alpha () dan Betha () dan Struktur Cincin
Monosakarida yang memiliki 5 atau lebih atom karbon, dalam larutan umumnya akan
memiliki formasi tertutub (ring), dalam bentuk struktur cincin 6 karbon, dan dinamakan
dengan Piran. Sedangkan monosakarida dengan 5 karbon, memiliki struktur tertutup
atau ring ya ng disebut dengan Furan. Gugus karboksil pada kedua jenis monosakarida
tersebut, membentuk ikatan kovalen dengan oksigen dari gugus hidroksilnya.
3.1.3.1. Proyeksi Fisher dan Harword
Proyeksi harword dinamakan juga dengan proyeksi rantai terbuka.

C1 HO C6 H2OH H
 |

H ⎯ C2 ⎯OH H C5─OH

│/ │ |
HO ⎯ C3 ⎯H
C4 H C1 ₌₌₌O
 │ \ OH H/
H⎯ C4 ⎯OH
\| |/

H ⎯ C5 ⎯OH H C3———C2

 ||
C6 H2 OH
H OH
DHGlulose Tahap awal dari pembentukan cincin 6
karbon
Fisher projection

C6 H2OH D glukosa dari proyeksi

|

H C5 ─OH H Fisher dapat menjadi
│/ │ |
formasi  atau  D
C4 H C1 ₌₌₌O
│ \ OH H/ glukopyranosa, yang

\| | / selanjutnya dikenal

H C3 ——— C2 dengan proyeksi

||

H OH Harword.

CH2OH CH2OH

| H |
H C ———O
│/│ \| H C ———O OH CH
/ \\
CH C │/│ \| / \\
O CH
│ \ OH H /| CH C ││
CH CH
OH \| | / OH │ \ OH H /| \\ /
C———C \\ /
OH \| | / H
CH
|| C———C

H OH ||

, D Glukopyranosa H OH

ß, D Glukopyranosa

Buku Ajar Biokimia Diploma 3 Fakultas Kehutanan UNIPA 39

40
BIomolekul

CH2OH CH2OH CH2OH OH O
|O | /\
│/ \│ |O | /\
|/ \ | │/ \│ /\

C H OH C |/ \ | CH CH
\/
|\ | | /| C H OH C \/
H C──C OH
|\ | | /| CH──CH
|| H C──C CH2OH
OH H Furanosa
||
,D fruktopuranosa
OH H
β,D fruktopuranosa

Tahapan subsitusi dari D-ribose untuk membentuk α atau β D-ribopyranose adalah
melalui tahapan sebagai berikut.

Pada keadaaan yang setimbang dan suhu konstant pada 31oC maka
monosakarida D glukosa dalam bentuk campuran (tidak murni) dengan kemungkinan
perbandingan adalah 64% akan dalam bentuk ß, D Glukopyranosa dan 36 % akan
dalam formasi. α, D Glukopyranosa. Sedangkan untuk D ribosa pada suhu dan
keadaan yang sama akan berada pada beberapa kemungkinan formasi yaitu 58.5% β D
ribopyranosa, 21.5% α D ribopyranosa, 13.5 % β ribofuranosa dan 6.5% α
D ribofuranosa.αβ

3.1.4. Reaksi kimia pada karbohidrat

Reaksi-reeaksi utama yang sangat dimanfaatkan untuk analisa kimia adalah reaksi
oksidasi –reduksi dari karbohidrat. Reaksi ini dapat terjadi bila reaksi reduksi
mempunyai aldehyde rantai terbuka dan bukan dalam keadaan siklik. Senyawa pereduksi
adalah senyawa yang cenderung menyumbang elektron dan senyawa oksidasi adalah
senyawa yang cenderung menerima elektron dalam reaksi kimianya.

Glukosa dan gula lain adalah mampu mereduksi senyawa-senyawa pengoksidasi
sehingga dinamakan senyawa sebagai gula pereduksi. Karbohidrat yang dapat mereduksi
pereduksi seperti Ag+, Cu+ dinamakan gula pereduksi. Uji gula pereduksi dapat
dilakukan dengan dalam suasana asam basa, seperti uji Tollen (komplek-komplek perak

Buku Ajar Biokimia Diploma 3 Fakultas Kehutanan UNIPA 40

41

BIomolekul
amonia), uji fehling (komplek tembaga tartarat) dan Uji benedict (komplek tembaga
sitrat).

CH2OH CH2OH CH2OH

|

H C ———O H | |
H C —OH
│/ │ \| H2O H C —OH Ag (ONH2) O
⇌ │/│ → │/│
CH C
│ \ OH H /| CH CH CH C - +Ag
│ \ OH H/ │ \ OH H/
OH \| | / OH

C———C OH \| |/ OH \| | / (Cermin

|| C———C C———C perak)

H OH || ||

H OH H OH

3.1.5. Ikatan-ikatan glikosida antar molekul-molekul monosakarida

Monossakarida terutama dalam bentuk hemiasetal siklik (masih mempunyai gugus
hidroksil/OH baik dalam struktur alfa ataupun beta. Gugus tersebut dapat bereaksi
dengan senyawa lain (monossakarida) menghasilkan asetal.

CH2OH CH2OH
| |

H C ———O OH + CH3OH H+ H C ———O OCH3

│/│ \| │/│ \| C (Asetal)

CH C CH
│ \ OH H /|
│ \ OH H /| OH \| | / H
OH \| | / H
C———C C———C
||
|| H OH
H OH
ß, D Glukosa Metil-ß, D Glukosida

Ikatan yang terbentuk antara C anomerik dengan gugus OR disebut ikatan Glikosida

3.1.6. Disakarida

Disakarida adalah merupakan reaksi antara dua molekul monosakarida dengan ikatan
glikosida. Terdapat 4 (empat) disakarida yang sering kita temuai yaitu: maltosa, laktosa,
sukrosa dan selobiosa.
a. Maltosa, adalah disakarida yang yang paling sederhana dan terbentuk dari hidrolisi

pati. Hidrolisis maltosa selanjutnya menghasilkan glukosa. reaksi antara molekul D

Buku Ajar Biokimia Diploma 3 Fakultas Kehutanan UNIPA 41

42

BIomolekul
glukosa yang dihubungkan oleh ikatan glikosida pada atom C1 dari glukosa yang
pertama dengan atom C4 dari glukosa yang kedua. Konfigurasi atom karbon
anomerik yang yang pertama adalah ikatan glikosida α (alpha). Tetapi bila bila dalam
bentuk kristal unit keduanya mempunyai konfigurasi β (beta). Dan kedua unit
berbentuk piranosa.

CH2OH CH2OH
|
H C ———O H |
H C ———O OH
│/│ \| │/│ \|
CH C
│ \ OH H / └──O───┘ CH C
┘ \ OH H /|
OH \| | / \| | / H
C———C
|| C———C
||
H OH
H OH

Maltosa, (4,O (α-D glukopirnosil)-β-D-glukopiranosa)

Karbon anomerik pada unit maltosa yang kedua adalah dalam formasi hemiasetal
(aldehyde) sehingga dalam bentuk kesetimbangan rantai terbuka, sehingga dalam uji
Tollen memberikan reaksi yang positif (gula pereduksi).

b. Selobiosa, adalah disakarida yang diperoleh dari hidrolisis parsial selulosa
sedangkan analisis lebih lanjut dari selobiosa menghasilkan D-glukosa.Sehingga
bisa dikatakan selobiosa adalah isomer dari maltosa. Perbedaanya adalah
konfigurasi pada konfigurasi β pada C1 dari unit pertama. Selobiosa termasuk gula
pereduksi

CH2OH

|

CH2OH H C ———O OH

| │/│ \|

H C ———O CH C

│ / │ \ |\ ⁄ │ \ OH H / │

CH C \⁄ \| | / H
│ \ OH H /│ O
C———C

OH \| | / H ||

C———C H OH

|| Maltosa, (4,O (α-D glukopirnosil)-β-D-
H OH glukopiranosa)

Selobiosa (4,O (β-D glukopirnosil)-β-D-glukopiranosa)

Buku Ajar Biokimia Diploma 3 Fakultas Kehutanan UNIPA 42

43

BIomolekul

c. Laktosa. laktosa adalah gula utama yang terdapat pada air susu ibu dan susu sapi.
Hidrolisis dari laktosa menghasilkan D glukosa dan D galaktosa dalam jumlah yang
sama. Karbon anomerik unit gaaktosa mempunyai konfigurasi β pada C1 dan
dihubungkan dengan gugus hidroksil pada C4dari unit glukosa. Kristal anomer α
(pada unit glukosa) dibuat komersiil dalam bentuk keju (butter).

CH2OH

CH2OH |
H C ———O H
| │/│ \|

OH C ———O CH C

│ / │ \ |\ ⁄ │ \ OH H / │

CH C \⁄ \| | / OH
C———C
│ \ OH H / │ O
||
OH \| | / H
C———C H OH

||

H OH

Laktosa (4,O (β-D galaktopirnosil)-α-D-glukopiranosa)

Gejala galaktosemia pada bayi yaitu ketidakmampuan tubuh bayi mencerna susu.
Ini terjadi karena tubuh kekuranan enzim yang dapat mengisomerkan galaktosa
menjadi glukosa. Penceahannya adalah dengan penghenmtian pemberian susu.

d. Sukrosa.Sukrosa adalah disakarida yang paling penting seukrosa dihasilkan oleh
tanaman melalui fproses fotosintesis. Hidrolisis sukrosa menghasilkan D glukosa
dan gula keto D fruktosa dalam jumlah yang sama. Ikatan glikosida yang terjadi pada
sukrosa sangat berbeda dengan disakarida yang telah diuraikan diatas. Atom C1 unit
glukosa yang pertama terikat pada karbon anomerik C2 pada unit fruktosa dan unit
fruktosa dalam bentuk furanosa.

Sukrosa adalah disakarida yang paling manis dibandingkan maltosa, Laktosa dan
selobiosa. Sakarin adalah gula buatan terapi untuk diabetus melitus (kencing manis).

CH2OH CH2OH OH
|

H C ———O H |O |

│/ │ \| │/ \ │

CH C |/ \ |
│ \ OH H /│ C H OH C

OH \ | |/ │ ─|\ | | /|
C──C CH2OH
C———C ── 0 ──

|| ||

Buku Ajar H OH 3 Fakultas Kehutanan UONHIPA H 43
Biokimia Diploma

Sukrosa, α D glukopiranosil-β,D fruktopuranosida

44
BIomolekul

Karena tidak terdapat gugus aldehid bebas, sehingga sukrosa tidak dapat mereduksi
pereaksi-pereaksi Tollen, Fehling dan benedict sehingga sukrosa bukan golongan gula
pereduksi.

3.1.7. Polisakarida.

Karbohidrat pada umumnya diketemukan dalm bentuk polisakarida dengan bobot
molrkul yang sangat tinggi. Polisakarida berfungsi sebagai penyimpan monosakarida,
unsur strukturan dalam dinding sel dan jaringat pengikat.

Dua jenis polisakarida yang utama adalah Homopolisakarida yaitu polisakarida
yang tersusun hanya dari satu unit monosakarida seperti Pati (starch) yang tersusun dari
D glukosa dan Heteropolisakarida yaitu yang tersusun oleh lebih dari satu jenis
monosakarida, seperti asam hialuronat pada jaringat pengikat. Polisakarida juga
dikelompokkan berdasarkan fungsi biologisnya yaitu: a) sebagai penyimpan polisakarida
(starch pada tanaman dan glikogen pada hewan), b) sebagai struktural polisakarida
(selullosa dan chitin). Berdasarkan strukturnya polisakarida dikelompokkan menjadi
struktur Linier, lingkar dan bercabang.

a. Pati (starch). Pati adalah jenis homopolisakarida yang terdapat pada tumbuh-
tumbuhan dan jamur. Dalam tumbuhan pati adalah campuran antara amilosa dan
amilopektin. Amilosa adalah polimer panjang dan lurus (tidak bercabang) dari D
glukosa yang diikatkan oleh ikatan α (1-4) dengan jumlah monomer 100 – 1000
unit. Amilopektin adalah polimer panjang dan bercabang dari D glukosa (amilosa
yang bercabang). Ikatan cabang terjadi pada α (1-6) glikosida. Percabangan terjadi
hampir setiap 25 monomer dan mengandung 15-25 monomer. Dalam sel makhluk
hidup amilopektin terdiri dari 300 – 6 000 unit monomer. Pati disimpan dalam
bentuk amilosa (10 – 20%) dan amilopektin (70-90%).

b. Glikogen. Glikogen adalah polisakarida yang terdapat pada hewan, bakteri dan juga
merupakan polimer yang bercabang α (1-4) lurus dan α (1-6) deengan frekuensi

Buku Ajar Biokimia Diploma 3 Fakultas Kehutanan UNIPA 44

45

BIomolekul
percabangan yang lebih banyak (tiap 8-10 glukosa) dibanding amilopektin. Polimer
glikogen lebih besar ± 600.000 monomer glukosa dibandingkan dengan pati.
Dalam hewan glikogen 10% terdapat dalam jaringan massa hati, 1% dalam jaringan
otot.

c. Selulosa. Selulosa adalah senyawa seperti serabut, liat, tidak larut dalam air dan
ditemukan pada dinding sel tumbuhan (batang, cabang dan dahan) dan semua
bagian berkayu jaringan tumbuhan. Kayu terdiri dari selulosa dan senyawa lain
sedangkan katun terdiri dari selulosa murni. Selulosa adalah merupakan
homopolisakarida linier yang tidak bercabang, terdiri dari ≥10 000 unit D glukosa
dengan ikatan α (1-4) glikosida. Kenapa kayu (selulosa) dan pati (selulosa) tetapi
kayu tidak bisa dijadikan bahan makanan manusia ?. Sekitar 40-45% bahan dalam
kayu adalah selulosa.

d. Hemiselulosa. Hemiselulosa adalah heteropolisakarida yang berfungsi sebagai
bahan pendukung dalam dinding sel. Hemiselulosa mudah dihidrolisis oleh asam
menjadi komponen-komponen monomer seperti D glukosa, D mannosa, D
galaktosa, D Xylosa dan sebagainya. Hemiselulosa menempati sekitar 20-30 % dari
massa kayu. Unsur-unsur organik/komponen kimia penyusun kayu antara kayu
daun jaurm (softwood) dan daun lebar (hardwood) diringkas pada Tabel 3.2.

e.

Tabel 3.2. Komposisi kimia kayu antara kayu daun jaurm (softwood) dan daun lebar (hardwood)

Tipe Selulosa (%) Hemiselulosa (%) Lignin (%)

Hardwood 40-44 15-35 18-25
Softwood 40-44 20-32 25-35

f. Lignin.Ligin adalah polimer dari unit-unit fenil propana yang komplek dengan
bobot molekul yang sangat tinggi. Gugus fenol adalah gugus siklik yang sangat
stabil. Lignin terdapat dalam sel dan dindingg sel tanaman sebagai penguat
struktural dan antar sel tanaman sebagai perekat.

g. Hubungan polisakarida dan sifat-sifat teknologi kayu. Polimer selulosa, liginin,
hemiselulosa dan zat kestraktif sangat mempengaruhi sifat-sifat teknologi kayu (wood
technological attributes) seperti kimia kayu, prekatan, pulp dan kertas dll.

Buku Ajar Biokimia Diploma 3 Fakultas Kehutanan UNIPA 45

46

BIomolekul

Pertanyaan

1. Jelaskan perbedaan dan persamaan antara karbohidrat yang dihasilkan oleh tanaman
berumbi seperti singkong dan beras dengan yang dihasilkan oleh kayu ?

2. Kenapa manusia tidak dapat memakan karbohidrat yang dihasilkan oleh kayu ?

Rekomendasi buku bacaan :

1. Anna Poejiadi (1994). Dasar-dasar Biokimia. Penerbit Universitas Indonesia. Jakarta.
2. Horton, R.H; Moran, L.A; Ochs, R.S; Rawn, J.D and Scrimgeour, K.G (1992).

Principle of Biochemistry. Neil and Patterson Publisher Prentice Hall.
New York.

Buku Ajar Biokimia Diploma 3 Fakultas Kehutanan UNIPA 46

47

BIomolekul

3.2. Protein

Topik ini membahas tentang senyawa kimia yang cukup penting dan melimpah di alam
yaitu protein. Maksud dan tujuan dari topik ini adalah agar mahasiswa diploma tiga (D3)
BDH dapat memahami dan menjelaskan tentang peran dan fungsi makromolekul
protein dalam kehidupan. Topik yang lebih spesific mendiskusikan tentang berbagai
jenis protein dan unsur penyusun protein.

Tujuan Instruktional Umum (TIU)

Setelah mempelajari bab ini mahasiswa diharapkan dapat:
6. Mendefinisikan peran dan fungsi protein dalam reaksi molekuler bokimiawi
7. Menjelaskan beberapa fungsi dari beberapa senyaa kimia golongan/derivat dari

protein.

Tujuan Instruktional Khusus (TUK)

Setelah menyelesaikan bab ini diharapkan:
6. Mahasiswa mampu menjelaskan kereaktifan dan kepolaran senyawa protein pada

berbagai reaksi molekuler.
7. Mahasiswa dapat menjelaskan fungsi dan peran senyawa protein dalam ilmu

kehutanan

Metoda Perkuliahan

Metoda perkuliahan dengan tatap muka didepan kelas dengan menggunakan alat bantu
Over Head Projector (OHP) dan bahan bantu lainnya

3.2.1. Fungsi Protein
Dalam tubuh makhluk hidup terdapat tiga polimer utama yaitu polisakarida, protein dan
asam nukleat. Polisakarida/karbohidrat dimanfaatkan sebagai sumber energi/cadangan
makanan dan unit struktural pada tanaman, asam nukleat bertugas dalam transformasi
informasi genetika atau hereditas (keturunan). Protein adalah polimer yang paling luas
perananya dalam makhluk hidup. Protein berfungsi sebagai hormon dan enzim,
berperan dalam memicu dan mengkatalis semua reaksi yang ada dalam tubuh. Otot dan
tendon berfungsi dalam pergerakkan tubuh. Kulit dan rambut berfungsi sebagai

Buku Ajar Biokimia Diploma 3 Fakultas Kehutanan UNIPA 47

48

BIomolekul
proteksi/pelindung luar tubuh, hemoglobin bertugas dalam transformasi oksigen
keseluruh tubuh/darah. Antibodi berfungsi sebagai zat penangkal semua benda asing
yang masuk tubuh.

3.2.2. Asam amino
Asam amino diperoleh dari hasil hidrolisis protein dalam bentuk asam α-amino. Reaksi
hidrolisis dari suati protein menjadi asam amino, dapat silukiskan secara sederhana pada
Gambar 3.5.

OO OO

α║ α║ ║║

≀—NHCHC—NHCHC—≀ H2O, H+ H2NCHCOH + H2NCHCOH +

dst │ │ kalor

│ │

RR Pada asamRamino gugusRamino terikat pada

O atom karbon yang bersebelahan dengan
α║
R——CH——COH gugus karboksilat atau pada posisi α,

│ sehingga karbon α (anomerik) adalah pusat
NH kiral.

sebuah asam amino

Gambar 3.5. Reaksi hidrolisis dari suatu protein menjadi asam amino

Penamaan asam amino dilambangkan dengan tiga huruf yang merupakan
singkatan dari penulisan peptida dan protein. Terdapat 20 jenis asam amino, dimana 12
jenis disintesis dari zat makanan tertentu, dan 8 lainnya tidak dapat disintesis oleh
manusia, sehingga perlu ditambahkan pada makanan. Kedelapan asam amino ini yang
dinamakan asam amino essential.

3.2.3. Sifat Keasaman dan Kebasaan Asam Amino

Molekul asam amino terdiri dari dua gugus fungsional yaitu gugus Amino dan gugus
Karboksilat. Asam amino mempunyai struktur ion dipolar,dimana gugus amino
membawa sifat ion amonium dan karboksil membawa sifat ion karboksila

O

R ──CH──C O-


+NH3

Buku Ajar Biokimia Diploma 3 Fakultas Kehutanan UNIPA 48


Click to View FlipBook Version