Com uma metodologia educativa embasada nos ideais das tendências pedagógicas progressistas, a Escola Menino Jesus, busca preparar seus educandos de forma crítica, possibilitando uma compreensão ampla da realidade histórico-social, situando o papel do sujeito como um ser que constrói sua realidade de maneira contínua e fundamentada em bons procedimentos éticos e morais.